تمام هارد دیسک ها برای خوانده شدن و قابل نوشتن بودن به یک فایل سیستم احتیاج
دارند. این مساله برای CD ها یا فلاپی ها هم صادق است. فایل سیستم مسوول
نامگذاری،ذخیره و بازیابی اطلاعات در قالب یک فایل است. این سیستم برای
سیستم عامل های مختلف،عملکردی متفاوت با بقیه دارد و حتی در بین نسخه های
مختلف ویندوز هم،گوناگونی وجود دارد. اما ویژگی خاص کلیه فایل سیستم های
فعلی ویندوز ،محدود بودن آن ها به شیوه استفاده از کلاسترها و همچنین به
سقف اطلاعاتی است که می توانند ذخیره کنند.کلاستر ،کوچکترین قطعه قابل
ذخیره کردن بر روی هارد دیسک است. پس در نتیجه اگر فایلی از یک کلاستر هم
کوچکتر باشد،سیستم ناچار است کل آن کلاستر را به فایل مذکور اختصاص دهد.
سکتور کوچکترین قطعه فیزیکی قابل ذخیره کردن اطلاعات است که بر اساس تعداد
بایت های موجود در یک قطعه آن محاسبه می شود. بنابراین مثلا” شما می توانید
در کامپیوترتان یک یا چند سکتور ۵۱۲ بایتی در هر کلاستر داشته باشید. هر ۴
کیلو بایت از فضای هارد دیسک معمولا” شامل هشت سکتور،است. بنابراین
کلاستریک یک مفهوم منطقی است و اندازه آن توسط فایل سیستم تعیین می شود. در
صورتی که سکتور یک مفهوم فیزیکی است و ربطی به سیستم عامل و فایل سیستم
ندارد. هر چه یک کلاستر تعدادد سکتورهای کمتری را بتواند در خود جای دهد و
این مفهوم منطقی خود را ظریف تر کند،بازدهی یک هارد دیسک چه از نظر حجم و
چه از نظر سرعت افزایش می یابد. در ویندوز ۹۵ از فایل سیستمی به نام FAT 16
استفاده می شود. این فایل سیستم می تواند یک پارتیشن ۲۵۶ مگابایتی را در
قالب کلاسترهای ۴ کیلوبایتی و یا پارتیشن ۲ گیگابایتی را به صورت کلاسترهای
۳۲ کیلوبایتی نگهداری کند. که در این صورت مثلا” اگر بخواهد یک فایل ۳۵
کیلوبایتی را ذخیره کند،باید دو کلاستر ۳۲ کیلوبایتی را به آن اختصاص داده و
از ۲۹ کیلوبایت باقیمانده آن صرف نظر کند. پس از این کار،فایل سیستم آدرس
کلاستر شروع یک فایل تعداد کلاسترهای اشغال شده توسط آن فایل و مشخصات
کلاستر آخر فایل مذکور را در جدولی به نام FAT (File Allocation Table :
جدول تخصیص فایل) ذخیره می کند. جدول FAT در فایل سیستم FAT16 در بیرونی
ترین شیار (Track ) یک دیسک یا در حقیقت همان تراک صفر ساخته و نگهداری می
شود. پس از مطرح شدن ویندوز ۹۵ در بازار سیستم عامل ها،تغییری در FAT 16
موجود در آن صورت گرفت تا فایل سیستم مذکور بتوانند اسامی فایل های با بیش
از ۸ حرف را در خود نگهداری کند. این تغییر که VFAT نام گرفت آغازی بود بر
فایل سیستم جدید ویندوز ۹۵ که با نام FAT 32 در سال ۹۶ عرضه شد. این فایل
سیستم به کاربران توانستند در محیط ویندوز ۹۵ برای اولین بار درایوهایی با
حجم حداکثر ۳۲ گیگابایت را در کامپیوتر خود داشته باشند که در اولین صورت
بزرگی هر کلاستر حداکثر فقط به ۱۶ کیلوبایت می رسید که بسیار مناسب این
ظرفیت بود.