ویندوز و لینوکس هر دو با صفحات HTML و JavaScript بدون هیچ مشکلی کار می‌کنند. در بسیاری موارد سرورهای لینوکس از پسوند فایل .html استفاده می‌کنند و سرورهای ویندوز از پسوند .htm ، اما هیچ تفاوت اساسی‌یی بین این فایل‌‌ها وجود ندارد .
دیتابیس
دیتابیس‌ها MySQL برای لینوکس و MSSQL برای ویندوزند. اما MySQL روی ویندوز نیز اجرا می‌شود. اگر قصد کار با دیتابیس‌های MSSQL را دارید هاست‌های ویندوز مناسب کار شماست .
آخرین اختلاف، حساسیت به حروف، است که در واقع بسیار مهم است .
در لینوکس نام فایل ها و دایرکتوری ها به بزرگی و کوچکی حروف حساس هستند.و اگر بازدید کننده به جای about.us در مرورگر About.Us را بزند با خطاب ۴۰۴ مواجه می شود
