با فایروال دو طرفه داخلی، نرم‌افزار ضدجاسوسی و قابلیت مقابله با سرقت اطلاعات شخصی، ویندوز ویستا بسیار امن‌تر از XP می‌باشد. مایکروسافت امنیت در ویستا را با به کار بردن سرویس کنترل و نظارت شدید بر روی پردازش‌های سیستم و عملکرد نرم‌افزارها که اجازه نمیدهد بدافزارها و نرم‌افزارهای مشکوک به راحتی خود را به فایل‌های سیستمی بچسبانند، یا در رجیستری جا خوش کنند و نهایتاً خود را وراد شبکه‌ای کنند که کامپیوتر به آن متصل است،تقویت کرده است. به همین صورت خاصیت حفاظت از دسترسی به شبکه(Network Access Protection یا NAP) اجازه نمیدهد که یک کامپیوتر آلوده به بدافزار امکان ارتباط با دیگر کامپیوترهای شبکه را به دست آورد چرا که ممکن است دیگر کامپیوترها را هم به راحتی آلوده کند.
ویندوز متهم به این شده است که بیشتر از لینوکس و یا مکینتاش در معرض خطر آلودگی و حمله انواع بدافزارها و ویروسها است و البته این موضوع به خاطر ضعف درونی این سیستم عامل از بدو پیدایش نیست بلکه به این خاطر است که این سیستم عامل بیش از هر سیستم عامل دیگری جهان را تسخیر کرده است پس طبیعی است که نویسندگان ویروسها هدف خود را روی این سیستم عامل قرار دهند.
